Вчені витягли РНК з тасманійського тигра, що стало першим випадком, коли цю молекулу секвенували у вимерлої тварини.
“Як і ДНК, РНК (рибонуклеїнова кислота) несе генетичну інформацію. Але замість подвійного ланцюга нуклеотидів, як у ДНК, РНК складається з одного ланцюга. Це підвищує ймовірність його деградації з часом і його складніше витягти з давно мертвої тканини. Але розуміння РНК необхідне для вивчення біології тварини”, – сказав Еміліо Мармол Санчес, докторант Центру палеогенетики Стокгольмського університету та Шведського музею природознавства. “РНК є посередником, який перетворює креслення ДНК у білки, які будують клітини; він також регулює клітинний метаболізм”.
«РНК дає вам уявлення про справжню біологію, про те, як метаболічно працювала клітина, коли вона була жива, безпосередньо перед тим, як клітина загинула», — сказав Мармол Санчес.
Це особливо цікаво для тасманійських тигрів, або тилацинів (Thylacinus cynocephalus), хижих сумчастих тварин, які жили в Австралії приблизно до 3000 років тому, коли популяція материка вимерла, і єдині вцілілі залишилися на острові Тасманія. Ці тварини, що вижили, були доведені до вимирання через полювання та відлов; остання відома особина померла в зоопарку в Гобарті, Австралія, в 1936 році. Незважаючи на те, що вони були сумчастими, тилацини були надзвичайно схожі на собак; це являє собою випадок конвергентної еволюції, в якій дві різні лінії дають тварину з великою кількістю подібностей, ймовірно, тому, що вона заповнює екологічну нішу.
Мармол Санчес і його колеги витягли РНК із висохлого тасманійського тигра, який помер близько 130 років тому, і проаналізували як м’язову, так і шкірну тканини. Першою перешкодою було показати, що вони можуть витягти РНК із реальної тварини, а не лише ДНК або РНК із забруднення навколишнього середовища (як люди, які обробляють шкіру). Порівнюючи послідовності, які вони виявили, вони відрізнили забруднення від справжньої РНК тилацину, сказав Мармол Санчес.
Використовуючи послідовності РНК, команда заповнила кілька прогалин у ДНК тасманійського тигра. (Оскільки РНК транскрибується з ДНК, можна екстраполювати послідовності ДНК з РНК.) В одному захоплюючому відкритті дослідники ідентифікували ніколи раніше описану послідовність мікроРНК, яка відіграє регуляторну роль, у якій гени експресуються в клітині, мабуть, присутній лише у тасманійських тигрів. Дослідники також знайшли іншу послідовність мікроРНК, яка раніше не була описана, але яка виявилася загальною для багатьох видів сумчастих.
Загалом дослідники підвищили кількість відомих мікроРНК у тасманійських тигрів з 62 до 325. Вони також помітили відмінності між шкірою та м’язовою тканиною лише на основі РНК у цих типах тканин. Не дивно, що зразки шкіри мали високий рівень РНК, пов’язаної з кератином — білком шкіри, волосся та нігтів — тоді як зразки м’язів мали високий рівень РНК, пов’язаної з білками м’язових волокон, такими як актин і міозин.
“Ці результати тепер можна використовувати для порівняння різних видів і еволюційного періоду”, – повідомили дослідники.
За словами Мармола Санчеса, команда планує секвенувати більше РНК з інших тканин тасманійського тигра, включаючи збережені органи. Ті ж методи можна використовувати для дослідження не тільки вимерлих тварин, але й стародавніх вірусів, багато з яких побудовані лише з РНК, а не ДНК, сказав він.
Нарешті, досліджуючи мамонтів, команда сподівається знайти навіть більш старі зразки РНК вимерлих тварин. Мамонти вимерли 4000 років тому, але дослідницька група працює над виділенням РНК із зразків віком до 50 000 років, сказав Мармол Санчес.
«Ви можете очікувати, що не так давно в майбутньому знайдете щось про РНК у мамонтів», — сказав він.
